MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome

Total Repeats: 3640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008229	TGAA	2	8	1358	1365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008229	A	6	6	1364	1369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008229	T	6	6	1396	1401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008229	A	6	6	1421	1426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008229	TTA	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008229	CTA	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008229	TTTA	2	8	1498	1505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008229	CAAAA	2	10	1555	1564	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008229	TGG	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008229	ACC	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008229	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008229	CAAGC	2	10	3084	3093	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008229	A	6	6	3112	3117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008229	A	6	6	3140	3145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008229	TTATC	2	10	4936	4945	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008229	TAA	2	6	4975	4980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008229	ATCAA	2	10	13133	13142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008229	A	6	6	13189	13194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008229	GAC	2	6	13195	13200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008229	A	6	6	13201	13206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008229	AATA	2	8	15804	15811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008229	T	7	7	15877	15883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008229	T	6	6	15945	15950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008229	T	6	6	15957	15962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008229	ATA	2	6	15967	15972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008229	A	7	7	16010	16016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008229	G	6	6	16020	16025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008229	CAAG	2	8	16055	16062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008229	AAC	2	6	16063	16068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008229	A	6	6	16106	16111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008229	ATT	2	6	16123	16128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008229	GTT	2	6	16194	16199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008229	A	6	6	16208	16213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008229	T	6	6	16222	16227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008229	T	6	6	16297	16302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008229	TAA	2	6	16352	16357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008229	T	6	6	16365	16370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008229	TCT	2	6	16456	16461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008229	A	6	6	16493	16498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008229	TGA	2	6	16502	16507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008229	GCTT	2	8	22959	22966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008229	AATA	2	8	22994	23001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008229	CTT	2	6	23928	23933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008229	AAAGA	2	10	26699	26708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008229	TCCCGC	2	12	26754	26765	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008229	A	6	6	27144	27149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008229	TTA	2	6	27165	27170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008229	GTT	2	6	27679	27684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008229	T	6	6	27792	27797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008229	T	6	6	27811	27816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008229	TAA	2	6	27828	27833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008229	AGAA	2	8	27868	27875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008229	AAG	2	6	27930	27935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008229	AGA	2	6	27962	27967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008229	GTA	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008229	GCAA	2	8	28105	28112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008229	CAT	2	6	28172	28177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008229	TAA	2	6	28225	28230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008229	GGAT	2	8	28270	28277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008229	TTA	2	6	28356	28361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008229	CCAAC	2	10	28368	28377	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_008229	T	6	6	28386	28391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008229	AAT	2	6	28405	28410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008229	TC	3	6	28433	28438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008229	TTC	2	6	28511	28516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008229	AAC	2	6	28523	28528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008229	GTT	2	6	28536	28541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008229	A	6	6	28558	28563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008229	AGA	2	6	28590	28595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008229	TCT	2	6	28619	28624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008229	TTA	2	6	28651	28656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008229	GTT	2	6	28681	28686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008229	AGTAA	2	10	28717	28726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008229	AG	3	6	28881	28886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008229	AG	4	8	28999	29006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008229	AGTGA	2	10	29014	29023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008229	AGT	2	6	29068	29073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008229	GCGA	2	8	29075	29082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008229	GCA	2	6	29217	29222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008229	TAC	2	6	29291	29296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008229	TGC	2	6	29525	29530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008229	GGA	2	6	29588	29593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008229	CAAA	2	8	29650	29657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008229	AT	3	6	29684	29689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008229	ATA	2	6	29709	29714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008229	GCT	2	6	29744	29749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008229	CGC	2	6	29750	29755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008229	GGTG	2	8	29811	29818	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008229	AATC	2	8	29823	29830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008229	AAC	2	6	29842	29847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008229	TG	3	6	29896	29901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008229	AGG	2	6	29917	29922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008229	AGC	2	6	29933	29938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008229	AAAG	2	8	29947	29954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008229	AGA	2	6	30047	30052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008229	AT	3	6	30136	30141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008229	CCG	2	6	30153	30158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008229	GTC	2	6	30184	30189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008229	G	6	6	30281	30286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008229	AGCT	2	8	30304	30311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008229	CGT	2	6	30426	30431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008229	GTC	2	6	30461	30466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008229	AGATG	2	10	30489	30498	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008229	GAA	2	6	30517	30522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008229	GCA	2	6	30577	30582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008229	TCCC	2	8	30602	30609	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_008229	TTGAA	2	10	30721	30730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008229	CGG	2	6	30742	30747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008229	TCC	2	6	30875	30880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008229	TAC	2	6	30916	30921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008229	ACC	2	6	31013	31018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008229	CAGG	2	8	31057	31064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008229	TGG	2	6	31073	31078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008229	CCT	2	6	31100	31105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008229	AGCC	2	8	31176	31183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008229	GGT	2	6	31236	31241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008229	TG	3	6	31244	31249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008229	CGT	2	6	31431	31436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008229	GAG	2	6	31478	31483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008229	GATG	2	8	31510	31517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008229	GTT	2	6	31534	31539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008229	AC	3	6	31565	31570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008229	CTG	2	6	31582	31587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008229	ACT	3	9	31696	31704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008229	T	6	6	31723	31728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008229	AAT	2	6	31737	31742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008229	AAG	2	6	31751	31756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008229	AG	3	6	31790	31795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008229	TAAAA	2	10	31862	31871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008229	TCT	2	6	31883	31888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008229	TAA	2	6	31907	31912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008229	AGA	2	6	31974	31979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008229	TGA	2	6	32030	32035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008229	T	6	6	32124	32129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008229	T	6	6	32138	32143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008229	T	6	6	32154	32159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008229	TTG	2	6	32211	32216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008229	GGTTTT	2	12	32222	32233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008229	GTT	2	6	32237	32242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008229	T	7	7	32263	32269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008229	GTG	2	6	32290	32295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008229	T	7	7	32319	32325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008229	GTT	2	6	32328	32333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008229	GTTTA	2	10	32359	32368	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008229	GGTTT	2	10	32377	32386	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008229	TC	3	6	32390	32395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008229	GTT	2	6	32420	32425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008229	GTT	2	6	32428	32433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_008229	AGC	2	6	152176	152181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_008229	CGC	2	6	152184	152189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
440	NC_008229	GGA	2	6	152192	152197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
441	NC_008229	AGA	2	6	152232	152237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_008229	CAG	2	6	152280	152285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_008229	AGTC	2	8	152353	152360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_008229	TGAC	2	8	152508	152515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
445	NC_008229	GATG	2	8	152580	152587	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
446	NC_008229	GTT	2	6	152591	152596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_008229	GA	3	6	152762	152767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_008229	GTC	2	6	152829	152834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_008229	AGG	3	9	152938	152946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
454	NC_008229	GAC	2	6	152955	152960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_008229	TCA	2	6	152967	152972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_008229	AGC	2	6	153216	153221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_008229	CCT	2	6	153297	153302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
460	NC_008229	CTT	2	6	153365	153370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_008229	TCTTTT	2	12	153408	153419	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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463	NC_008229	TTTAG	2	10	153936	153945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
464	NC_008229	TGA	2	6	153980	153985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_008229	TC	3	6	154118	154123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
468	NC_008229	T	6	6	154124	154129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_008229	AAT	2	6	154135	154140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_008229	TCT	2	6	154149	154154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_008229	ATC	2	6	154166	154171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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474	NC_008229	TCA	2	6	154421	154426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_008229	AAC	2	6	154481	154486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_008229	T	6	6	155309	155314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_008229	TCATT	2	10	155339	155348	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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